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受體理論
(一)受體的基本概念
是存在于細胞膜上、胞漿內或細胞核上的大分子化合物,能與特異性配體結合并產生效應。
(二)受體特性
飽和性、特異性、可逆性、高親和力、結構專一性、立體選擇性、區(qū)域分布性、亞細胞或分子特征、與藥理活性相關、存在內源性配體。
(三)受體的分類
按存在位置:細胞膜受體、細胞漿受體,胞核受體。
按作用機制分:門控離子通道型受體(含離子通道受體),G蛋白偶聯受體,具有酪氨酸激酶活性受體,核受體(調節(jié)基因表達的受體)。
(四)受體的調節(jié)
向下調節(jié),向上調節(jié);同種調節(jié),異種調節(jié)。
分子對接的種類
分子對接的種類主要包括:
(1)剛體對接:指在對接過程中,研究體系(受體和配體)的構象不發(fā)生變化。適合考察比較大的體系,如蛋白質和蛋白質間以及蛋白質和核酸之間的對接。
(2)半柔性對接:指在對接過程中,研究體系尤其是配體的構象允許在一定的范圍內變化。適合處理大分子和小分子間的對接,對接過程中,小分子的構象一般是可以變化的,但大分子是剛性的。
(3)柔性對接:指在對接過程中,研究體系的構象基本上可以自由變化的。一般用于精確考慮分子間的識別情況。由于計算過程中體系的構象可以變化,所以計算耗費最大。
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